システム
ダブルスロットシステム
ニンテンドーＤＳに、本作とＧＢＡのスパロボを挿した状態で電源を入れると、資金と専用の強化パーツが貰える。
対応ソフトは、「Ａ」、「Ｒ」、「Ｄ」、「Ｊ」、「ＯＧ」、「ＯＧ２」、「第二次スパロボ」の７作品。
※貰えるパーツは、ソフトによって変わる。
もらえるパーツに関してはよくある質問をご覧ください。
マルチコンボシステム
従来のコンボ攻撃では、一列に連なった敵に対してのみ攻撃を行えたが、 今作では上下左右いずれかに隣接した敵ユニットにも攻撃を加えることが可能に。
パイロットの技能「コンボ」レベル＋１の数までの敵ユニットに攻撃可能。
（最大５機まで攻撃可能）
スキルパーツシステム
従来のシステムとは異なり、スキルパーツを消費し、特殊技能を付加することが出来るシステム。
パイロット養成システム
パイロットのレベルが１上げるごとに１ポイント入手できるポイントで、このポイントを消費することにより能力値を上げることが出来るシステムです。
交代システム
出撃しているユニットとまだ出撃していないユニットを交代出来るシステム。
一度交代したユニットを再度出撃させることは出来ない。
支援要請システム
出撃していない味方ユニットに、援護攻撃または援護防御を要請するパイロット特殊技能。
味方ユニットと隣接していなくても援護を受けることができるが、１マップにつき技能レベルの数しか使用できない。（援護のようにターンごとに回復しない）
なお支援したユニットのＨＰ、ＥＮ、弾数は、そのマップ中は回復しないので注意。
支援を受けるユニットがいる地形に、支援するユニットが適応していることが条件。
お気に入りシステム
今作では好きな作品を３つ選ぶことが可能で、効果は選んだ作品に登場するユニットの最大改造値が１５段階になる他、獲得経験値と獲得資金が増える。
なお獲得経験値、資金は作品によって異なり、登場するユニットの総数が少ない作品ほど多く貰える。
ショップシステム
１週目は、強化パーツとスキルパーツの売却のみ可能で、２週目からユニットとすべての強化パーツ（ダブルスロット特典のパーツは除く）が購入可能になる。
ユニットは１機のみ購入可能。